جلد 29، شماره 8 - ( 8-1401 )
جلد 29 شماره 8 صفحات 177-166 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Research code: 524
Ethics code: 524
Clinical trials code: 524
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Rohani S, Hajighasemi F. Compatibility of B-Sheets with Epitopes Predicted by Immunoinformatic in Human IgG. RJMS 2022; 29 (8) :166-177
URL: http://rjms.iums.ac.ir/article-1-7293-fa.html
URL: http://rjms.iums.ac.ir/article-1-7293-fa.html
روهانی سهیلا، حاجی قاسمی فاطمه. تطبیق صفحات بتا با اپی توپ های پیش بینی شده توسط ایمونوانفورماتیک در مولکول IgG انسان. مجله علوم پزشکی رازی. 1401; 29 (8) :166-177
دانشیار، گروه ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران ، fatimahajighasemi@gmail.com
چکیده: (801 مشاهده)
زمینه و هدف: آنتی‌‌بادی‌ها یا ایمونوگلوبولین‌ها immunoglobulins (Igs)])[، توسط لنفوسیت‌های B تولید شده و برای تشخیص برخی بیماری‌ها شامل عفونت‌ها ارزشمند هستند. سنجش Igs نیازمند ابزارهای تشخیصی اختصاصی از جمله آنتی‌بادی‌های منوکلونال] monoclonal antibodies (MAbs)[ بوده و تولید MAbs مستلزم تعیین اپیتوپهای Igs است. اپیتوپ ناحیه‌ای از آنتی‌ژن است که توسط آنتی‌بادی شناسایی می‌شود. صفحات بتا نقش مهمی در ایجاد اپیتوپ دارند. IgG فراوانترین Ig سرم بوده و نقش مهمی در دفاع علیه عوامل عفونی دارد. هدف این پژوهش شناسایی صفحات بتا و تطبیق آنها با اپیتوپ های پیش بینی شده در IgG انسان توسط ایمونوانفورماتیک میباشد.
روش کار: توالی اسیدهای آمینه IgG مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم IgG توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0) و محل قرار گیری صفحات بتا و اپیتوپهای IgG با استفاده از پایگاه داده IEDB (Immune Epitope Database) تعیین شدند.
یافته‌ها: ناحیه‌ای از IgG که بیشترین احتمال قرارگیری صفحات بتا را دارد، در زنجیره سبک در محدوده اسیدآمینه های ۱50 تا ۱۷۵ و در زنجیره سنگین در محدوده اسیدامینه‌های ۱4۰-۱3۰، ۱7۰-۱6۰ ،200- 190 ، 245- 220، 410- 375 و ۴۲5-۴۲0، قرار دارد. سه اپیتوپ در زنجیره سبک در ناحیه بین اسید آمینه‌های شماره ۱60- ۱50، ۱75- ۱60و 205 -180 و سه اپیتوپ نیز در زنجیره سنگین در ناحیه بین اسید آمینه‌های شماره 270- 200 ، 360- 29۰ و40۰- 380 شناسایی شدند.
نتیجه‌گیری: غالب اپیتوپ های IgG انسان در نواحی از مولکول که بیشترین احتمال قرارگیری صفحات بتا هست، قرار گرفته‌اند که نمایانگر انطباق نسبتا بالای صفحات بتا با اپیتوپهای IgG است. این یافته‌ها در شناسایی هرچه بهتر اعمال IgG، طراحی اپیتوپهای ایمنی زا برای تولیدMAbs اختصاصی به هدف بهینه سازی کیت‌های تشخیصی IgG و همچنین تولید پروتئین‌های مشابه جهت اهداف تشخیصی مفید هستند.
روش کار: توالی اسیدهای آمینه IgG مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم IgG توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0) و محل قرار گیری صفحات بتا و اپیتوپهای IgG با استفاده از پایگاه داده IEDB (Immune Epitope Database) تعیین شدند.
یافته‌ها: ناحیه‌ای از IgG که بیشترین احتمال قرارگیری صفحات بتا را دارد، در زنجیره سبک در محدوده اسیدآمینه های ۱50 تا ۱۷۵ و در زنجیره سنگین در محدوده اسیدامینه‌های ۱4۰-۱3۰، ۱7۰-۱6۰ ،200- 190 ، 245- 220، 410- 375 و ۴۲5-۴۲0، قرار دارد. سه اپیتوپ در زنجیره سبک در ناحیه بین اسید آمینه‌های شماره ۱60- ۱50، ۱75- ۱60و 205 -180 و سه اپیتوپ نیز در زنجیره سنگین در ناحیه بین اسید آمینه‌های شماره 270- 200 ، 360- 29۰ و40۰- 380 شناسایی شدند.
نتیجه‌گیری: غالب اپیتوپ های IgG انسان در نواحی از مولکول که بیشترین احتمال قرارگیری صفحات بتا هست، قرار گرفته‌اند که نمایانگر انطباق نسبتا بالای صفحات بتا با اپیتوپهای IgG است. این یافته‌ها در شناسایی هرچه بهتر اعمال IgG، طراحی اپیتوپهای ایمنی زا برای تولیدMAbs اختصاصی به هدف بهینه سازی کیت‌های تشخیصی IgG و همچنین تولید پروتئین‌های مشابه جهت اهداف تشخیصی مفید هستند.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
ایمنی‌شناسی
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
