جلد 25، شماره 12 - ( 12-1397 )
جلد 25 شماره 12 صفحات 83-74 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
sargazi Z, Haddad-Mashadrizeh A, Mashreghi M, Housaindokht M R. Statistical analysis of MAGE-A4 antigen expression in relative cancers and predicting antigen presentation by HLA-B37 molecule based on bioinformatics tools. RJMS 2019; 25 (12) :74-83
URL: http://rjms.iums.ac.ir/article-1-5263-fa.html
URL: http://rjms.iums.ac.ir/article-1-5263-fa.html
سرگزی زهره، حدادمشهدریزه علی اکبر، مشرقی منصور، حسین دخت محمدرضا. آنالیز آماری بیان آنتیژن MAGE-A4 در سرطان‌های وابسته و پیش بینی عرضه آنتیژن با مولکول HLA-B37 مبتنی بر روش‌های بیوانفورماتیکی
. مجله علوم پزشکی رازی. 1397; 25 (12) :74-83
دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران ، a.haddad@um.ac.ir
چکیده: (3058 مشاهده)
زمینه و هدف: ایمونوتوکسین‌ها از جمله راهبردهای امیدوار‌کننده در درمان هدفمند سلول‌های سرطانی هستند که با مکانیسم اتصال اختصاصی به آنتیژنهای توموری عمل میکنند. لذا واکاوی این نوع از آنتی‌ژن‌ها و پایش ویژگی‌های ساختاری و عمکردی آنها فراهم‌کننده بستری در ارتباط با توسعه این نوع از داروها می‌باشد. در این تحقیق، مطالعه خانواده آنتی‌ژنی MAGE بر اساس آزمون‌های بیوانفورماتیکی در دستور کار قرار گرفته است.
روش کار: در گام نخست، آنالیزآماری بیان آنتیژنهای خانواده MAGE در انواع سرطانها با استفاده از برنامه SPSSانجام گرفت. بعد از تعیین MAGE-A4 به عنوان آنتیژن برتر، براساس مرور منابع، اپی‌توپ‌های اتصالی MAGE-A4 با ایزوفرمهای مختلف HLAشناسایی شد. سپس با استفاده از برنامههای BIMAS و SYFPEITHI اپی‌توپ‌های اتصالی گزارش شده در منابع تائید شد. شاخص پایداری و ایمونوژنسیتی اپی‌توپ‌ها به ترتیب با استفاده از برنامههای PROTPRAM وIEDB انجام شد. به منظورتعیین میل اتصالی و پایداری کمپلکس HLA-B37-peptide درشرایط شبه واقعی، نرم افزارهای اتوداک وینا وگرومکس 5.1 مورداستفاده قرارگرفت.
یافته‌ها: نتایج حاصل از این آزمون منجر به آشکارسازی میزان و گستره بیانی بالای MAGE-A4 در مقایسه باسایر اعضای این خانواده شد. همچنین پپتید VDELAHFLLمشتق شده ازMAGE-A4 با بالاترین میزان پایداری وایمونوژنسیتی مطلوب آشکارشد. از سوی دیگر کمپلکس HLA-B37-VDELAHFLL با پایین‌ترین میزان نمودار RMSD به عنوان پایدارترین کمپلکس ارزیابی گردید.
نتیجه‌گیری: به طورکلی نتایج حاصل از این تحقیق نشان دادکه پپتید مورد نظر VDELAHFLL از آنتیژن MAGE-A4 ممکن است در تولید آنتیبادی مونوکلونال وتوسعه واکسن در درمان مدرن سرطان مدنظر قرارگیرد.
روش کار: در گام نخست، آنالیزآماری بیان آنتیژنهای خانواده MAGE در انواع سرطانها با استفاده از برنامه SPSSانجام گرفت. بعد از تعیین MAGE-A4 به عنوان آنتیژن برتر، براساس مرور منابع، اپی‌توپ‌های اتصالی MAGE-A4 با ایزوفرمهای مختلف HLAشناسایی شد. سپس با استفاده از برنامههای BIMAS و SYFPEITHI اپی‌توپ‌های اتصالی گزارش شده در منابع تائید شد. شاخص پایداری و ایمونوژنسیتی اپی‌توپ‌ها به ترتیب با استفاده از برنامههای PROTPRAM وIEDB انجام شد. به منظورتعیین میل اتصالی و پایداری کمپلکس HLA-B37-peptide درشرایط شبه واقعی، نرم افزارهای اتوداک وینا وگرومکس 5.1 مورداستفاده قرارگرفت.
یافته‌ها: نتایج حاصل از این آزمون منجر به آشکارسازی میزان و گستره بیانی بالای MAGE-A4 در مقایسه باسایر اعضای این خانواده شد. همچنین پپتید VDELAHFLLمشتق شده ازMAGE-A4 با بالاترین میزان پایداری وایمونوژنسیتی مطلوب آشکارشد. از سوی دیگر کمپلکس HLA-B37-VDELAHFLL با پایین‌ترین میزان نمودار RMSD به عنوان پایدارترین کمپلکس ارزیابی گردید.
نتیجه‌گیری: به طورکلی نتایج حاصل از این تحقیق نشان دادکه پپتید مورد نظر VDELAHFLL از آنتیژن MAGE-A4 ممکن است در تولید آنتیبادی مونوکلونال وتوسعه واکسن در درمان مدرن سرطان مدنظر قرارگیرد.
واژه‌های کلیدی: ایمونوتوکسین، آنتیژن MAGE4، داکینگ، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی، آنتی بادی مونوکلونال، پپتید
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
بیولوژی (زیست شناسی)
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
