Research code: 1234
Ethics code: 1234
Clinical trials code: 1234
1- پردیس فرزانگان، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران،
2- پردیس فرزانگان، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران ، m.hassanlou@semnan.ac.ir
3- گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران،
4- گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران ، تهران، ایران،
چکیده: (168 مشاهده)
زمینه و هدف: ژن فیبروسارکومای آپونوروتیک ماهیچهای (musculoaponeurotic fibrosarcoma یا MAF) یک فاکتور رونویسی است که نقش مهمی در رشد و تمایز بسیاری از اندامها و بافتها ایفا میکند. ژن MAF ، هم به عنوان یک انکوژن بالقوه و هم به عنوان تنظیمکننده پاسخ ایمنی نقش پیچیدهای در سرطانها ایفا میکند. پیچیدگی عملکرد بسیاری از ژنها مربوط به microRNA ((miRNA هایی است که در درون ژنها وجود دارند و به کمک پروموتر ژن میزبان بیان میشوند. در این تحقیق قصد داریم تا به کمک ابزارهای بیوانفورماتیک و تایید به کمک دادههای ترانسکریپتومیکس وجود miRNA های جدید را در ژن MAF بررسی کنیم.
روش کار: به این منظور به کمک نرم افزار SSCprofiler ، ساختارهای ساقه-حلقه مشابه پیش سازهای microRNA، در توالی ژن MAF شناسایی شد. ساختار دوم این ساختارها به کمک نرم افزار RNAfold با حداقل انرژی آزاد برای توالی RNA ترسیم شد. توالی microRNAهای بالغ با استفاده از نرم افزارMature Bayes مورد شناسایی قرار گرفت. آنالیز دادههای حاصل از microRNA seq بیان microRNA های بدست آمده را در بافتهای توموری مورد تایید قرار داد.
یافتهها: نتایج نشان داد که ژن MAF دارای سه توالی miRNA با ساختار ساقه-حلقه است که حفاظت شدگی بالایی در میان موجودات مختلف دارد و در دادههای حاصل از microRNA seq نیز در بافتهای مختلف بیان نشان میدهد.
نتیجهگیری: به طور کلی شواهد حاکی از وجود miRNAهای جدیدی است که در ژن MAF کدگذاری میشوند. حضور این miRNAها میتواند توجیه کننده بخشی از پیچیدگیهای عملکرد پروتو-انکوژن MAF باشد و شاید در آینده بتواند افقهای جدیدی را در درمان سرطانها در پیش روی جامعه پزشکی قرار دهد.
نوع مطالعه:
پژوهشي |
موضوع مقاله:
ژنتیک