Research code: 01
Ethics code: 0
Clinical trials code: 0
شناسایی نشانگرهای زیستی برای تشخیص کارسینوم هپاتوسلولار و بیان ژن X ویروس هپاتیت B در باکتری E.coli"
کارشناس ارشد شیمی دارویی، موسسه آموزش عالی زاگرس، کرمانشاه، ایران ، modafe.1400mmmm@gmail.com
چکیده: (45 مشاهده)
HCC (هپاتوسلولار کارسینوما) مرتبط با ویروس هپاتیت B (HBV) یکی از بدخیمی های مهم با مرگ و میر بالا در سراسر جهان است. HCC اکثر قریب به اتفاق سرطان کبد (تقریباً 90٪) را تشکیل می‌دهد. پروتئین X ویروس هپاتیت B (HBx)، یک عامل مهم اتیولوژیک HCC مرتبط با HBV است. بیشتر شواهد موجود ارتباط بین حضور HBx و ایجاد HCC را نشان می‌دهد. سالانه حدود 1 میلیون نفر بر اثر سیروز و HCC ثانویه به عفونت HBV می‌میرند. واکسیناسیون هپاتیت B نوزادان از سال 1372 در ایران صورت گرفت که قبل از آن شیوع هپاتیت B در ایران 2-5% بود. و پس از واکسیناسیون این آمار به 2% تقلیل یافته است. در سال 1397، 1400000 نفر در کشور مبتلا به هپاتیت B بودند. در ایران 80% موارد مبتلا به سرطان کبد دارای سابقه بیماری هپاتیت B می‌باشند. کمتر از 1/3 بیمارانی با تشخیص HCC با روش‌های موجود درمان می‌شوند. بنابراین تشخیص HCC در مراحل اولیه برای بقای بیمار حیاتی و شناسایی نشانگرهای زیستی برای تشخیص زودهنگام HCC یک ضرورت به شمار می آید. به این منظور در این پژوهش پروتئین‌های مشترک موثر در HCC و پروتئین‌های که با پروتئین X ویروس هپاتیت B برهمکنش دارند با استفاده از مقالات و پایگاه‌های داده، شناسایی شدند و شبکه برهمکنشی پروتئین - پروتئین (PPI) میان آن‌ها با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape3.7.1 ترسیم گردید. سپس از با استفاده از افزونه Centiscape پروتئین‌های hub در این شبکه مشخص شدند.TP53، HSP90AB1، HSPB1، PIN1، HIF1A و HSPA4 پروتئین‌های مهم شبکه‌اند. 4 مسیر بیولوژیکی این پروتئین‌های hub با استفاده از نرم-افزارFunrich3.1.3 تعیین شد. 100% این پروتئین‌ها در مسیر VEGF and VEGFR signaling network نقش داشتند و 80% پروتئین‌ها درمسیر ErbB receptor signaling network، Insulin Pathway، Class I PI3K signaling events نقش داشتند. با توجه به نقش پروتئین X ویروس هپاتیت B در پیشروی بیماری HCC، طراحی پرایمر برای ژن X انجام شد و قطعه مورد نظر از طریق PCR به دست آمد. در مرحله بعد اتصال قطعه مورد نظر به پلازمید بیانی pET-M33 و با استفاده از کلنی PCR اتصال قطعه مدنظر به پلازمید تایید شد. قطعه پروتئین به صورت هترولوگ در E. coli BL21(DE3) بیان شد و حضور پروتئین مورد نظر توسط SDS-PAGE تایید شد. پس از تایید بیان پروتئین، خالص سازی آن به وسیله ستون Ni2 + - NTA انجام شد.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
