زهرا شاکران، مختار نصرتی، زینب شاکران،
جلد ۲۵، شماره ۲ - ( ۲-۱۳۹۷ )
چکیده
زمینه و هدف: عفونت ناشی از ویروس هپاتیت سی یکی از معضلات مهم پیش روی سلامت عمومی ویکی از عوامل اصلی مرگ و میر در جهان است. بنابراین اخیرا پژوهش‌های زیادی با هدف معرفی ترکیبات جدید و موثر ضد هپاتیت سی بویژه ترکیبات گیاهی انجام شده است. هدف از پژوهش حاضر غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده(های) پروتئاز ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی Cornus officinalis و Syzygium aromaticum می‌باشد.
روش کار: ابتدا ساختار سه بعدی پروتئاز ویروس هپاتیت سی و ترکیبات غالب گیاهان مذکور به ترتیب از پایگاه داده‌های پروتئین وPubchem دریافت شد. سپس خصوصیات فیزیکوشیمیایی ترکیبات گیاهی و پتانسیل سمیت سلولی و جهش زایی آن‌ها با استفاده از نرم افزارهایSwiss ADME و Toxtree پیش‌بینی شد. در نهایت ترکیبات گیاهی و پروتئاز هپاتیت سی در بررسی داکینگ مولکولی با استفاده از نرم افزار iGemdock ۲,۱ مورد مطالعه قرار گرفتند.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که ترکیبات مورد بررسی فاقد پتانسیل جهش‌زایی و سمیت سلولی هستند. نتایج بدست آمده حاکی از برهمکنش‌های قوی و مناسب ترکیبات مورد مطالعه با آنزیم NS۳/۴A خصوصا در ناحیه‌ی مسئول فعالیت پروتئازی است. افزون بر این مشخص شد که ۱,۲,۶-Trigalloylglucose،Hyperoside، Isoquercitrin، Rhamnetin، Ursolic acid و Methyl salicylate برهمکنش‌های قوی‌تری را با اسیدآمینه‌های کلیدی جایگاه فعال آنزیم ایجاد می‌کنند.
نتیجه‌گیری: بر اساس نتایج حاصل شده می‌توان نتیجه گرفت که ترکیبات گیاهی مورد بررسی می‌توانند به عنوان نامزد‌های مناسبی جهت بررسی‌های برون و درون تنی به منظور دستیابی به ترکیبات ضد هپاتیت سی مورد ارزیابی قرار گیرند.
