سعید کیانی،
جلد ۰، شماره ۰ - ( ۱-۱۴۰۳ )
چکیده
HCC (هپاتوسلولار کارسینوما) مرتبط با ویروس هپاتیت B (HBV) یکی از بدخیمی های مهم با مرگ و میر بالا در سراسر جهان است. HCC اکثر قریب به اتفاق سرطان کبد (تقریباً ۹۰٪) را تشکیل می‌دهد. پروتئین X ویروس هپاتیت B (HBx)، یک عامل مهم اتیولوژیک HCC مرتبط با HBV است. بیشتر شواهد موجود ارتباط بین حضور HBx و ایجاد HCC را نشان می‌دهد. سالانه حدود ۱ میلیون نفر بر اثر سیروز و HCC ثانویه به عفونت HBV می‌میرند. واکسیناسیون هپاتیت B نوزادان از سال ۱۳۷۲ در ایران صورت گرفت که قبل از آن شیوع هپاتیت B در ایران ۲-۵% بود. و پس از واکسیناسیون این آمار به ۲% تقلیل یافته است. در سال ۱۳۹۷، ۱۴۰۰۰۰۰ نفر در کشور مبتلا به هپاتیت B بودند. در ایران ۸۰% موارد مبتلا به سرطان کبد دارای سابقه بیماری هپاتیت B می‌باشند. کمتر از ۱/۳ بیمارانی با تشخیص HCC با روش‌های موجود درمان می‌شوند. بنابراین تشخیص HCC در مراحل اولیه برای بقای بیمار حیاتی و شناسایی نشانگرهای زیستی برای تشخیص زودهنگام HCC یک ضرورت به شمار می آید. به این منظور در این پژوهش پروتئین‌های مشترک موثر در HCC و پروتئین‌های که با پروتئین X ویروس هپاتیت B برهمکنش دارند با استفاده از مقالات و پایگاه‌های داده، شناسایی شدند و شبکه برهمکنشی پروتئین - پروتئین (PPI) میان آن‌ها با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape۳,۷.۱ ترسیم گردید. سپس از با استفاده از افزونه Centiscape پروتئین‌های hub در این شبکه مشخص شدند.TP۵۳، HSP۹۰AB۱، HSPB۱، PIN۱، HIF۱A و HSPA۴ پروتئین‌های مهم شبکه‌اند. ۴ مسیر بیولوژیکی این پروتئین‌های hub با استفاده از نرم-افزارFunrich۳,۱.۳ تعیین شد. ۱۰۰% این پروتئین‌ها در مسیر VEGF and VEGFR signaling network نقش داشتند و ۸۰% پروتئین‌ها درمسیر ErbB receptor signaling network، Insulin Pathway، Class I PI۳K signaling events نقش داشتند. با توجه به نقش پروتئین X ویروس هپاتیت B در پیشروی بیماری HCC، طراحی پرایمر برای ژن X انجام شد و قطعه مورد نظر از طریق PCR به دست آمد. در مرحله بعد اتصال قطعه مورد نظر به پلازمید بیانی pET-M۳۳ و با استفاده از کلنی PCR اتصال قطعه مدنظر به پلازمید تایید شد. قطعه پروتئین به صورت هترولوگ در E. coli BL۲۱(DE۳) بیان شد و حضور پروتئین مورد نظر توسط SDS-PAGE تایید شد. پس از تایید بیان پروتئین، خالص سازی آن به وسیله ستون Ni۲ + - NTA انجام شد.
