fa استفاده از روش های بیوانفورماتیک و سیتوژنتیک مولکولی در بررسی ناهنجاریهای کروموزومی سلول های سرطان پوست القائی در رت های نژاد SD ژنتیک Genetic پژوهشي Research <strong><span style="color:#0070c0;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">زمینه و هدف: </span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یکی از مهم‌ترین اهداف تحقیقات در سرطان شناسی کشف تغییرات کروموزومی است که در تشکیل سلو ل‌های نئوپلاستیک و تومورهای بدخیم دخالت دارد. سرطان پوست در ایران بر طبق گزارش کشوری رتبه اول را در بین زنان ایران دارد. در این تحقیق به مطالعه سرطان پوست القایی در موش‌های نژاد</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> SD </span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">پرداخته می‌شود و با روش‌های اینفورماتیک نواحی مشابه آنها در کروموزوم‌های انسان و همچنین مهم‌ترین ژن‌های کاندید در آن نواحی گزارش می‌گردد</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span><br> <strong><span style="color:#0070c0;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">روش کار:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در این پژوهش از موش صحرائی نژاد </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">SD</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> به عنوان مدل حیوانی جهت القاء سرطان پوست استفاده گردید که طی آن</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">mg </span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;10 از ماده کارسینوژنیک </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;DMBA</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">محلول شده در روغن کنجد به رت‌های تحت تیمار به روش زیر جلدی تزریق گردید. از تومور‌های بدست آمده برای کشت سلولی و تهیه کروموزوم‌های متافازی استفاده شد. بعد از رنگ‌آمیزی به روش </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">GTG</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، کروموزوم‌های متافازی رنگ شده با ایدئوگرام موش صحرایی طبیعی مقایسه گردید. با مطالعه کروموزوم‌های متافازی، مشترک‌ترین تغییرات کروموزومی بین مجموعه‌های کروموزومی ثبت گردید. بر اساس چگونگی تغییرات و محل آن‌ها و با کمک پایگاه‌های اطلاعاتی، لیستی از ژن‌ها وهمچنین نقش احتمالی آن‌ها با توجه به روش مقایسه ژنومیک بین موش صحرایی و انسان تهیه شد.</span></span></span><br> <strong><span style="color:#0070c0;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافته‌ها:</span></span></span></strong> <span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">تغییرات کروموزومی ایجاد شده طیف وسیعی از ناهنجاری‌های عدی و ساختاری را شامل گردید و بطور واضح، قطعاتی از کروموزوم‌های شماره 5، 8 و 9 دچار حذف شدگی و همجنین بخش‌هایی از کروموزوم شماره 7 دچار اضافه شدگی ساختاری گردیده بودند. همچنین با استفاده از روش سیتوژنتیک مولکولی فیش کاهش تعداد نسخه‌های ژنی در ژن‌های </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CDKN2B</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">KLF4</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در کروموزوم 5 رت‌های تیمار شده نشان داده شد. </span></span></span><br> <strong><span style="color:#0070c0;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجه‌گیری:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با استفاده از روش‌های مقایسه ژنومیک و مطالعه مقالات علمی در ارتباط با ژن های مستقر در نواحی کروموزومی تغییر یافته، پیشنهاد می‌گردد که ژن‌های</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CASP9</span></span></span></span><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CDC2L1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CNR2</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DFFA</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DFFA</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CCND3</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">EEF1A1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ASAP1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PTK2</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DAG1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">GPX1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">MLH1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TGFBR2</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TUSC2</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">KLF4</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">SLC31A1</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span></span></em><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CDKN2B</span></span></span></span></em><em><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span></span></em> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ELAVL2</span></span></span></span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">و</span></span></span> <em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">FANCG</span></span></span></span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">احتمالاً می‌توانند از جمله مهم‌ترین ژن‌ها در بروز سرطان پوست در مدل ایجاد شده باشند، لذا این گروه از ژن‌ها و ژن‌های مرتبط با آن‌ها برای مطالعات بیشتر و دقیق‌تر بطور کاندید پیشنهاد می‌گردند</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span><br> &nbsp; <strong>Background:</strong> One of the most important research objectives in the field of cancer is the discovery of chromosomal changes involved in the formation of neoplastic cells and malignant tumors. According to the country report, skin cancer in Iran is ranked first among Iranian&#39;s women. In this research, we will study skin induced skin cancer in SD mice and will report similar areas in human chromosomes and also the most important candidate genes in those regions.<br> <strong>Methods:</strong> In this study, SD rats were used as an animal model for induction of skin cancer in which 10 mg of carcinogens DMBA soluble in sesame oil were injected subcutaneously to rats. The tumors were obtained for cell culture and the preparation of meta-phasic chromosomes. After staining with GTG method, banding chromosomes in meta-phasic stage were compared with the normal rats&#39; ideogram. By examining metaphase chromosomes, the most common chromosomal changes were recorded between chromosomal sets. Based on their changes and location and with the help of databases, a list of genes and their possible role were made according to the genomic comparison method between rats and humans.<br> <strong>Results:</strong> The results of the chromosomal changes included a wide range of abnormalities, and clearly, fragments of chromosomes number 5, 8 and 9 were eliminated, and also parts of chromosome number 7 were subject to chromosomal structural addition. Also, using the cytogenetic molecular method of the FISH, reduction of copy numbers in the CDKN2B and KLF4 genes was shown in the chromosome 5 of the treated rats.<br> <strong>Conclusion:</strong> Through using genomic comparison methods and studying scientific articles about the genes based on modified chromosomal regions, it is suggested that the genes including <em>CASP9, CDC2L1 CNR2, DFFA, DFFA, CCND3, EEF1A1, ASAP1, PTK2, DAG1, GPX1, MLH1, TGFBR2, TUSC2, KLF4, SLC31A1, CDKN2B, ELAVL2</em> and FANCG may be one of the most important genes in the development of skin cancer in our model, so this group of genes and related genes are suggested for more and more accurate studies. رت نژاد SD, DMBA, سرطان پوست, نواربندی گیمسا, فیش Breast cancer, SD rat, chromosomal changes, G-banding. FISH 9 20 http://rjms.iums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4177-1&slc_lang=fa&sid=1 Ahmad Hamta احمد همتا a-hamta@araku.ac.ir 3900319475328460048737 3900319475328460048737 Yes University of Arak, Arak, Iran گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه اراک، اراک، ایران Ayda Hamta آیدا همتا 3900319475328460048738 3900319475328460048738 No Tehran University of Medical Sciences دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران