Razi Journal of Medical Sciences
مجله علوم پزشکی رازی
RJMS
Medical Sciences
http://rjms.iums.ac.ir
39
journal39
2228-7043
2228-7051
en
jalali
1395
11
1
gregorian
2017
2
1
23
152
online
1
fulltext
fa
تحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه
Microarray Images Analysis to Detect Breast Cancer
آزمون تصویری
Test video
پژوهشي
Research
<p dir="RTL" style="margin-bottom:0cm;margin-bottom:.0001pt;text-align:justify;text-justify:inter-ideograph;line-height:normal;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">زمینه و هدف</span></span></strong>: <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">فناوری ریزآرایه به عنوان ابزاری بسیار قدرتمند جهت مطالعه و تحلیل رفتار هزاران ژن به طور همزمان میباشد. تصاویر حاصل از فناوری ریزآرایه نقش مهمی در کشف و درمان بیماریها دارند. هدف از این پژوهش، ارائه یک روش خودکار جهت استخراج و تحلیل دادهها از تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص بیماریهای سرطانی میباشد. </span></span></p>
<p dir="RTL" style="margin-bottom:0cm;margin-bottom:.0001pt;text-align:justify;text-justify:inter-ideograph;line-height:normal;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">روش کار</span></span></strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">: سیستم پیشنهادی شامل سه فاز اصلی</span></span> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">پردازش تصویر، داده­کاوی</span></span> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">و شناسایی بیماری می­باشد. در فاز پردازش تصویر عملیاتی مانند شناسایی مکان ژن­ها، حذف پسزمینه و استخراج دادههای خام از تصویر انجام میگیرد. فاز دوم شامل نرمالسازی دادههای استخراج شده و انتخاب ژنهای مؤثرتر میباشد. در فاز سوم، با توجه به داده­های استخراج شده عمل شناسایی و تشخیص بیماری انجام می­گیرد.</span></span></p>
<p dir="RTL" style="margin-bottom:0cm;margin-bottom:.0001pt;text-align:justify;text-justify:inter-ideograph;line-height:normal;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافتهها</span></span></strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">: در این پژوهش مجموعه تصاویر ریزآرایه سرطان سینه از پایگاه داده دانشگاه استنفورد مورد استفاده قرارگرفته است. دقت روش پیشنهادی جهت تعیین مکان ژن­ها و تشخیص نوع سرطان سینه به ترتیب بالغ بر 98% و 45<sub>/</sub>95% می­باشد.</span></span></p>
<p dir="RTL" style="margin-bottom:0cm;margin-bottom:.0001pt;text-align:justify;text-justify:inter-ideograph;line-height:normal;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجهگیری</span></span></strong><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">: نتایج به دست آمده از این روش نسبت به دیگر روش­های موجود در زمینه تحلیل تصاویر و داده­های ریزآرایه از دقت بالاتری برخوردار است؛ همچنین نسبت به آزمایش­های بیولوژی از دسترسی آسان­تر و هزینه کمتری برخوردار است.</span></span></p>
<p dir="RTL"></p>
<p><strong>Background</strong>: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases.</p>
<p><strong>Methods: </strong>The proposed system consists of three main phases of image processing, data mining, and detection of disease. The image processing phase is accompanied with some operations such as identifying the location of genes, deleting the background, and extracting the raw data from the images. The second phase includes data normalization and selection of more effective genes. The disease is identified and recognized in the third phase using the extracted data.</p>
<p><strong>Results: </strong>In this study it has been used from breast cancer microarray images from Stanford University database. The accuracy of the proposed method to locate genes and diagnosis of breast cancer is up to 98 and 95.45%, respectively.</p>
<p><strong>Conclusion:</strong> The obtained results indicate that the proposed method is more accurate than other existing methods in microarray analysis. In addition, the proposed method is easily implemented and less costly compared to the clinical tests.</p>
ریزآرایه, پردازش تصویر, دادهکاوی, سرطان سینه
microarray, image processing, data mining, breast cancer
77
87
http://rjms.iums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2814-1&slc_lang=fa&sid=1
Nastran
Dehghan
نسترن
دهقان
dehghan_nastaran@shahroodut.ac.ir
3900319475328460035308
3900319475328460035308
No
Shahrood University of Technology, Shahrood, Iran
دانشگاه صنعتی شاهرود، شاهرود، ایران
Hamid
Hassanpour
حمید
حسن پور
h.hassanpour@shahroodut.ac.ir
3900319475328460035309
3900319475328460035309
Yes
Shahrood University of Technology, Shahrood, Iran
دانشگاه صنعتی شاهرود، شاهرود، ایران
M. R.
Abbaszadegan
محمد رضا
عباس زادگان
abbaszadeganmr@mums.ac.ir
3900319475328460035310
3900319475328460035310
No
Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran
دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران.